Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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