Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.6 ms