Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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TCIRG1Q13488 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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TCIRG1Q13488 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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TCIRG1Q13488 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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TCIRG1Q13488 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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