Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXE3Q13461 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.6 ms