Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPN13Q12923 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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