Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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NFIAQ12857 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NFIAQ12857 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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