Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SFTPDP35247 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SFTPDP35247 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SFTPDP35247 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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