Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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