Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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PTPRBP23467 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRBP23467 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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PTPRBP23467 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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PTPRBP23467 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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PTPRBP23467 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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