Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPAN9O75954 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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TSPAN9O75954 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
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TSPAN9O75954 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TSPAN9O75954 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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TSPAN9O75954 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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TSPAN9O75954 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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TSPAN9O75954 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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TSPAN9O75954 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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TSPAN9O75954 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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TSPAN9O75954 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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