Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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LRRTM2O43300 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LRRTM2O43300 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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