Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHACTR1Q9C0D0 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PHACTR1Q9C0D0 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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