Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ARXQ96QS3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ARXQ96QS3 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ARXQ96QS3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ARXQ96QS3 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ARXQ96QS3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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