Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD8Q96LT4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD8Q96LT4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms