Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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