Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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