Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPROQ16827 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPROQ16827 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTPROQ16827 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTPROQ16827 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPROQ16827 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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