Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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