Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms