Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FXNQ16595 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FXNQ16595 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
FXNQ16595 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FXNQ16595 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FXNQ16595 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FXNQ16595 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FXNQ16595 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
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