Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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