Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ALX1Q15699 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
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