Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKIV2LQ15477 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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