Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYCP1Q15431 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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