Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDCD1Q15116 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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