Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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NR1I3Q14994 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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NR1I3Q14994 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1I3Q14994 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1I3Q14994 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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