Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RFTN1Q14699 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms