Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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