Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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