Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL4BQ13620 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4BQ13620 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4BQ13620 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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