Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TUSC3Q13454 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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TUSC3Q13454 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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