Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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