Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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