Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM28Q13263 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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