Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1BQ13112 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms