Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1AQ13111 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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