Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPS1Q13098 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPS1Q13098 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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