Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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CSTF3Q12996 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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CSTF3Q12996 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CSTF3Q12996 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
CSTF3Q12996 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CSTF3Q12996 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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