Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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