Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
BPTFQ12830 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
BPTFQ12830 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
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