Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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ERVPABLB-1P60509 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ERVPABLB-1P60509 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVPABLB-1P60509 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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