Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CASKO14936 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CASKO14936 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CASKO14936 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CASKO14936 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CASKO14936 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CASKO14936 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms