Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MEIS1O00470 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MEIS1O00470 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MEIS1O00470 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms