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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
AL442067.1-201
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223 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
AC134878.1-201
ENST00000619901
243 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
CXADR-202
ENST00000356275
270 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.76-201
ENST00000362931
109 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNU6-653P-201
ENST00000363074
106 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.133-201
ENST00000363428
110 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.162-201
ENST00000363683
102 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.556-201
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113 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
MIR216A-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1228P-201
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107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORA40.5-201
ENST00000391061
128 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORD111-201
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94 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
AC073127.1-201
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333 nt
TSL 3
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNRPGP8-201
ENST00000454064
226 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
AC067940.1-201
ENST00000458411
300 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1045P-201
ENST00000516321
107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP255-201
ENST00000516370
107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP153-201
ENST00000516498
76 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORD36C-201
ENST00000516733
66 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
uc_338.17-201
ENST00000619633
179 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
AP003174.1-201
ENST00000306533
376 nt
TSL 2
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORD45.3-201
ENST00000363836
72 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.292-201
ENST00000364904
97 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORA27-201
ENST00000384323
126 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
MT-TN-201
ENST00000387400
73 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SNORD89-201
ENST00000390981
114 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RPS26P5-201
ENST00000418544
335 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RPS29P24-201
ENST00000486345
171 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
RNU6-958P-201
ENST00000516995
106 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
OPN4
Q9UHM6
SAMD9-203
ENST00000620985
6754 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
0.53
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR377-201
ENST00000362145
69 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.168-201
ENST00000363740
102 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
SNORD27-201
ENST00000363981
72 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-125P-201
ENST00000384505
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.562-201
ENST00000384695
113 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR568-201
ENST00000385036
95 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR92A1-201
ENST00000385233
78 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-205P-201
ENST00000390858
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR936-201
ENST00000401264
98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AF228730.3-201
ENST00000436691
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
DIP2A-IT1-201
ENST00000442434
428 nt
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU7-73P-201
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63 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AC137770.1-201
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU7-53P-201
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60 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AC097639.2-201
ENST00000603159
172 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AP000753.3-201
ENST00000604083
169 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AC011921.3-201
ENST00000605540
361 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
7SK.10-201
ENST00000621414
298 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
EVI2B-201
ENST00000330927
1999 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-103P-201
ENST00000363686
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-728P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1335P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1189P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.410-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-110P-201
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BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNY1P4-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-913P-201
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BASIC
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OPN4
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SNORA79-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
AC090844.1-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
AL118496.2-201
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BASIC
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OPN4
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U7.7-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.668-201
ENST00000516233
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BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1110P-201
ENST00000516462
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR4264-201
ENST00000583520
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BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AC104465.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP347-201
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119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.23-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP499-201
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119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.308-201
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BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.350-201
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98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.477-201
ENST00000384352
108 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6ATAC33P-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AC023051.1-201
ENST00000414098
876 nt
TSL 5
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AL035398.1-201
ENST00000430869
322 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AL138752.1-201
ENST00000452964
351 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU7-96P-201
ENST00000459535
64 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
COX6CP6-201
ENST00000490840
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BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-561P-201
ENST00000516222
102 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AL136317.1-201
ENST00000612653
226 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR342-201
ENST00000362212
99 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.7-201
ENST00000362352
102 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.65-201
ENST00000362846
100 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.205-201
ENST00000364128
113 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNY4P28-201
ENST00000365281
93 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
SNORA1-201
ENST00000384107
130 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.440-201
ENST00000384120
114 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR605-201
ENST00000385078
83 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
TRAJ2-201
ENST00000390535
66 nt
APPRIS P1
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-493P-201
ENST00000391321
108 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR1827-201
ENST00000408549
66 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
HMGN1P33-201
ENST00000432945
451 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MTND3P2-201
ENST00000438452
342 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
AL121914.1-201
ENST00000450188
156 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU2-11P-201
ENST00000459191
187 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNU6-998P-201
ENST00000515894
101 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNY3P16-201
ENST00000516338
101 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP121-201
ENST00000516537
101 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR4711-201
ENST00000578274
70 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
OPN4
Q9UHM6
MIR3129-201
ENST00000581095
76 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
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