Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SEH1LQ96EE3 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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