Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX54Q8TDD1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms