Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SEC23AQ15436 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SEC23AQ15436 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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