Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYCP1Q15431 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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