Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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NR1I3Q14994 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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NR1I3Q14994 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1I3Q14994 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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