Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERV3-1Q14264 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.2 ms