Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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UBE4AQ14139 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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UBE4AQ14139 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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UBE4AQ14139 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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UBE4AQ14139 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBE4AQ14139 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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